Review Tugas Jamur Bermanfaat:
Analisis Proteomik Verticillium albo-atrum
Oleh: Muhammad Akhid Syib'li
Oleh: Muhammad Akhid Syib'li
Layu verticillium adalah penyakit vaskuler yang disebabkan oleh patogen tular tanah (soil born disease) jamur Verticillium albo-atrum dan Verticillium dahliae. Isolat V. albo atrum memiliki kemampuan menginfeksi dan menyebar yang berbeda-beda sesuai dengan tingkat virulensinya, dengan menghasilkan gejala yang ringan atau yang mematikan. Maka dari itu, diperlukan suatu analisis yang lebih kompleks sehingga dapat diketahui lebih rinci mengenai jamur ini. Dalam penelitian ini digunakan pendekatan proteomik untuk mendapatkan informasi yang lebih banyak mengenai proses infeksi dan untuk mengidentifikasi hubungan protein terhadap infeksi dan dilakukan analisis simultan dari total protein pada dua dimensi gel poliakrilamida.
Peneltian ini kemudian menghasilkan rata-rata, 2645 terdeteksi oleh PG1 (660 valid) dan 2529 spot terdeteksi oleh PG2 (721 valid). Sebuah spot dikatakan valid jika spot ini menunjukkan setidaknya 9 replikasi gel (lebih dari 12) dan jika spot dapat melewati penyaringan kriteria. Terdapat 173 spot yang hanya ditunjukkan oleh PG1 pathotype dan 234 spot hanya ditemukan pada PG2 pathotype; 487 spot diobservasi dan ditemukan di kedua pathoptype.
Gambar 1. Filia pada Konidiospora Spesies Verticillium,
Setiap Filia Berisikan Massa Konidia (www.cals.ncsu.edu)
Setiap Filia Berisikan Massa Konidia (www.cals.ncsu.edu)
Sebenarnya pemanfaatan agen-agen hayati saat ini telah berkembang, dan pemanfaatannya cukup merebak di para peneliti untuk diobservasi lebih lanjut. Tetapi pada tingkat petani belum tersosialisasikan lebih luas, sehingga pemanfaatan agen-agen hayati dalam pengendalian di tingkat petani masih terbatas. Berdasarkan penelitian Hanson (2000) yang menggunakan Trichoderma virens saat perlakuan benih mampu menekan perkembangan penyakit tular tanah Verticillium albo-atrum pada tanaman kapas dengan signifikan.
Daftar Pustaka
Mandelc, S., Radisek, S., Jamnik, P., Javornik, P. 2008. Proteomik Analysis of The Fungus Verticillium albo-atrum. University Ljubljana, Slovenia.
Hanson, L.E, 2000. Reduction of Verticillium Wilt Symptoms in Cotton Following Seed Treatment with Trichoderma virens. The Journal of Cotton Science 4:224-231
DeSavigny, T. 2008.Verticillium alboatrum (Online, http:// www. cals. ncsu. edu/ course/ pp728/ alboatrum/ Verticillium _albo -atrum. html, diakses 13 Januari 2009)
Anonymous. 2008. Trichoderma virens (Online, http://genome.jgi-psf.org/img/trive.gif, diakses 13 Januari 2009)
Gambar 2 Miselium Trichoderma virens (http://genome.jgi-psf.org/img/trive.gif)
Daftar Pustaka
Mandelc, S., Radisek, S., Jamnik, P., Javornik, P. 2008. Proteomik Analysis of The Fungus Verticillium albo-atrum. University Ljubljana, Slovenia.
Hanson, L.E, 2000. Reduction of Verticillium Wilt Symptoms in Cotton Following Seed Treatment with Trichoderma virens. The Journal of Cotton Science 4:224-231
DeSavigny, T. 2008.Verticillium alboatrum (Online, http:// www. cals. ncsu. edu/ course/ pp728/ alboatrum/ Verticillium _albo -atrum. html, diakses 13 Januari 2009)
Anonymous. 2008. Trichoderma virens (Online, http://genome.jgi-psf.org/img/trive.gif, diakses 13 Januari 2009)



